Вроде бы почти одно и тоже(сам так долго думал), но различия все же есть.
Прайс-агрегаторы работают, в основном, по CPC модели и «гонят» трафик на ваш сайт на основе вашего фида. Т.е. сами заказы обрабатываются в обычном режиме интернет-магазина: через корзину, телефон, обратные формы и т.д. Доставка организуется на стороне интернет магазина.
Маркетплейсы же могут полностью заменить магазин(такие как Озон, WB, Amazon) — т.е. обработка заказа осуществляется полностью на их стороне. Работа идет по комиссионной схеме, и процент в основном зависит от категории товара. Т.е. по сути маркетплейс это и есть магазин, от вас требуется только сам товар.
На каком из них разместиться, решать вам, а я вам конечно помогу: